Karabuğday doğal olarak gluten içermez; adının içinde “buğday” geçse de bu bir tahıl olmayıp kuzukulağıgiller familyasından gelen bir tohumdur ve bu nedenle çölyak hastaları veya gluten intoleransı olan bireyler için güvenli bir alternatif oluşturur.
Karabuğdayın gluten içermemesi, glutenle ilişkili proteinlerin (buğday, arpa, çavdar gibi Triticeae familyası gluteni) bu bitkide bulunmamasından kaynaklanır.
Ancak ürünlerdeki olası çapraz bulaşma (örneğin glutenli ürünlerle aynı fabrikada işlenmesi) nedeniyle ambalaj üzerindeki etiket bilgisini kontrol etmek önemlidir. Karabuğday unu ve karabuğdaydan yapılan birçok ürün de glutensizdir, fakat üretim sürecine göre gluten kontaminasyonu riskine karşı dikkatli olunmalıdır.
